Autoimmunerkrankung ist in der Heilkunde ein Oberbegriff für Krankheiten, deren Ursache eine überschießende Reaktion des Immunsystems gegen körpereigenes Gewebe ist.

Das Immunsystem erkennt irrtümlicherweise körpereigenes Gewebe als zu bekämpfenden Fremdkörper.
Unter Autoimmunerkrankungen versteht man Krankheiten, bei denen sich das Immunsystem nicht gegen eindringende Bakterien wehrt, sondern gegen den Körper. Warum sich die Immunabwehr so verhält, ist nur in wenigen Fällen bekannt und sehr selten behandelbar. In den meisten Fällen kann man lediglich eine Linderung der Symptome herbeiführen, die Krankheit aber nicht heilen. Die genauen Ursachen für die Entstehung von Autoimmunkrankheiten sind bisher noch unbekannt.
Üblicherweise ist das Immunsystem in der Lage, zwischen Fremdkörpern (Viren, Bakterien) und körpereigenem Gewebe zu unterscheiden. Bei einer Autoimmunerkrankung erkennt das Immunsystem bei den Betroffenen aber körpereigenes Gewebe als Krankheitserreger, so dass bestimmte Antikörper gebildet werden (Teile des eigenen Körpers werden durch das Immunsystem bekämpft).
Die Symptome sind je nach Grunderkrankung vielseitig.
Eine Diagnose wird anhand der jeweiligen Symptome gestellt, wobei noch Bluttests durchgeführt werden müssen, in denen die entsprechenden Antikörper nachgewiesen werden können.